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凝膠過(guò)濾層析是利用凝膠過(guò)濾層析介質(zhì)的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，根據(jù)分子大小進(jìn)行分離的一種方法。其基本原理是含有不同尺寸大小分子的樣品進(jìn)入層析柱后，越小的分子進(jìn)入珠體內(nèi)部更深，向柱下移動(dòng)的速度越慢，根據(jù)分子大小不同依次按一定順序從柱內(nèi)流出而達(dá)到分離的目的。凝膠過(guò)濾層析介質(zhì)像分子篩一樣，將大小不同的分子進(jìn)行分離，凝膠過(guò)濾也叫分子篩層析或尺寸排阻層析。

凝膠過(guò)濾介質(zhì)具有不同孔徑大小的多孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，不同的凝膠介質(zhì)其孔徑大小和分布不同，因而要根據(jù)生物分子大小的不同選擇合適的凝膠過(guò)濾介質(zhì)，同時(shí)需要考慮其機(jī)械性能。